Chercheur postdoctorant (H/F) en conservation et partage de données neuroscientifiques

Un poste postdoctoral en conservation et partage de données neuroscientifiques est disponible au sein du groupe de recherche en neuroinformatique de l'Institut des neurosciences de Paris-Saclay, dirigé par Andrew Davison. Le Human Brain Project est en train de développer un référentiel de données ouvertes pour les neurosciences.

Informations générales

• Référence : UMR9197-ANDDAV-006
• Lieu de travail : GIF-SUR-YVETTE
• Date de publication : mardi 15 septembre 2020
• Type de contrat : CDD Scientifique
• Durée du contrat : 28 mois
• Date d’embauche prévue : 1 décembre 2020
• Quotité de travail : Temps complet
• Rémunération : entre 2696 et 4291 € bruts mensuels selon expérience
• Niveau d’études souhaité : Doctorat
• Expérience souhaitée : Indifférent

Missions

Un poste postdoctoral en conservation et partage de données neuroscientifiques est disponible au sein du groupe de recherche en neuroinformatique de l’Institut des neurosciences de Paris-Saclay, dirigé par Andrew Davison.
Le Human Brain Project est en train de développer un référentiel de données ouvertes pour les neurosciences, conformément aux principes FAIR (Facile à trouver, Accessible, Interopérable, Réutilisable). Le rôle de notre groupe est de mettre fortement l’accent sur la réutilisation : en s’assurant que tous les ensembles de données ont des métadonnées détaillées de haute qualité, de sorte qu’elles puissent être utilisées dans la création et la validation de modèles, et dans les analyses approfondies ; et en fournissant des outils pour faciliter la réutilisation des données.
Le poste est disponible immédiatement et est financé jusqu’au 31 mars 2023. Le salaire est fonction de l’expérience et sera à l’échelle de recherche standard du CNRS.

Activités

Le candidat retenu sera responsable de l’élaboration et de l’amélioration des schémas de métadonnées, des protocoles et des flux de travail de conservation des données d’activité neuronale (y compris les enregistrements par patch clamp, l’imagerie par fluorescence, les enregistrements multiélectrodes et les IRMf), et de la coordination du processus de conservation et d’annotation en profondeur. Le projet impliquera une collaboration intensive avec d’autres chercheurs, conservateurs et développeurs de logiciels au sein du groupe de recherche, du Human Brain Project et des communautés plus larges de neurosciences/neuroinformatique.

Compétences

Les candidats doivent être titulaires d’un doctorat en neurosciences, en informatique, en bibliothéconomie ou en sciences de l’information, ou dans une discipline connexe, ou être sur le point de terminer leurs études de doctorat dans l’un de ces domaines.
Une expérience des méthodes expérimentales en neurosciences, des technologies du Web sémantique et/ou des approches de gestion de l’information sera particulièrement utile. La connaissance de la programmation informatique, en particulier l’utilisation du langage Python, serait également un avantage. Un bon niveau d’anglais est essentiel.

Contexte de travail

L’Institut des Neurosciences Paris-Saclay est une unité de recherche du CNRS et de l’Université Paris-Saclay, située à Gif-Sur-Yvette. L’équipe Davison (https://neuropsi.cnrs.fr/fr/icn/andrew-davison/) développe des outils et des approches informatiques novatrices pour le partage de données, la modélisation et la simulation en neurosciences, ainsi que pour le calcul inspiré du cerveau. Ce poste est financé par le Human Brain Project, une initiative phare de l’UE dans laquelle plus de 100 partenaires travaillent ensemble pour construire une infrastructure informatique pour les neurosciences et pour la recherche liée au cerveau en médecine et en informatique.

Andrew Davison - Contact
Institut NeuroPSI à Saclay
Tél: +33(0) 1 69 82 3451

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24 mois

Développeur(se) Python (H/F)

L'équipe Neuroscience Computationnelles de NeuroPSI recrute un/une Développeur(se) Python pour le développement de logiciels libres pour la modélisation de signaux neuronaux et de réseaux de neurones. Ce travail contribuera au projet Européen Human Brain Project.

28 mois

Ingénieur informatique (DevOps) H/F

L'ingénieur(e) assurera le déploiement et la maintenance des infrastructures matérielles et web pour le groupe de recherche en Neuroinformatique (50% du temps), où il participera au développement, à la documentation, au contrôle qualité et au déploiement de services et applications web. Il assurera également la gestion du parc informatique de l'ensemble du Département en Neurosciences Intégratives (50% du temps).