Équipe François Rouyer

Génétique Moléculaire des Rythmes Circadiens
Logiciel Faas

Fly Activity Analysis Suite for Mac OSX

FaasX 32 bits n'est plus pris en charge, il est remplacé par Faas en tant qu'application 64 bits compatible avec MacOS 10.14 (Mojave) et supérieur.

(FaasX est toujours téléchargeable pour les versions précédentes de MacOS. <10.14)

Faas est une application 64 bits MacOS (10.14 -> 10.15 et au-dessus) qui est étroitement liée à BRP (Brandeis Rhythm Package, D.A. Wheeler) pour traiter les données d'activité de mouches DAMSystem (Trikinetics) et offre une interface graphique plus pratique.

Il a été développé par M. Boudinot à l'Institut de Neurobiologie Alfred Fessard, CNRS, dans le groupe Génétique Moléculaire des Rythmes Circadiens de François Rouyer.

Faas est autonome et ne nécessite aucun autre logiciel, les fichiers de description d'expérimentation utilisés par Faas peuvent être créés plus facilement à l'aide de Microsoft Excel et du modèle excel "Experiment" fourni.

Caractéristiques

Faas permet d'exécuter une analyse par lots de l'activité circadienne collectée par DAMSystem avec résultats sous forme de fichiers de texte tabulé et  graphiques, telle que:

• tracé cartésien et tracé double intriqué de l'activité quotidienne (Actogram).

• activité moyenne à chaque intervalle de temps pendant le cycle circadien entraîné (Éduction).

• analyse des périodes :

• Périodogramme (Cycle_p)

• Autocorrelogram (Autocorrelation)

• Spectre de puissance MESA (MESA)

• analyse de phase (Phase).

Faas installation kits :

Faas_Kit.zip  Kit version :  1.1 (64-bits)

FaasX_Kit.zip- Kit version : 1.22  (32-bits). N’est plus supporté!

L'ensemble de données fourni peut être utilisé pour tester votre installation et vous donne des exemples de fichiers nécessaires pour utiliser Faas.

Contacts:

Michel Boudinot :

François Rouyer :

xxxxxxxxxxxx

Old Version

FaasX is a MacOSX (10.4 ->10.14 and above) universal application that is closely related to BRP (Brandeis Rhythm Package, D.A. Wheeler) to process DAMSystem (Trikinetics) fly activity data and provides you a more convenient graphic interface.
It was developed by M. Boudinot at the Institut de Neurobiologie Alfred Fessard, CNRS, in the group Molecular Genetics of Circadian Rhythms of François Rouyer.

FaasX is self sufficient and does not need any other software, but experiment description files that are needed by FaasX can be more easily created using Microsoft Excel and the provided Experiment template with the help of the corresponding applescript makeFaasXFiles application.

Features

FaasX allows to run batch analysis on circadian activity collected by DAMSystem such as :
• circadian and double plot of daily activity (Actogram).
• tabulated average activity for entrainment data with graphical rendering (Eduction)
• period analysis periodogram with tabulated text and graphical results :

• Periodogram (Cycle_p)
• Autocorrelogram (Autocorrelation)
• MESA power spectrum (MESA)
• phase analysis (Phase).

FaasX installation kit

FaasX_Kit.zip- Kit version : 1.22
The provided data set can be used to test your installation and gives you example of files that are needed to run FaasX.